目前,关于番茄的分类尚未完全统一,多将番茄属分为普通番茄、多毛番茄、秘鲁番茄、奇士曼尼番茄和细叶番茄等几个复合体种群,每个复合体种群又可分为不少变种。目前栽培的番茄都属于普通番茄,包括5个变种:①栽培番茄,植株茎茁壮,分枝多,匍匐性,果大,叶多,果形扁圆,果色可分红、粉红、橙、黄等,多数栽培品种均属此变种;②樱桃番茄,果实小,圆球形,果径约2厘米,果色红、橙或黄色,形如樱桃,两心室,植株强壮,茎细长,叶小色淡绿;③大叶番茄,叶大,叶缘有浅裂或无缺刻,形似马铃薯叶,故又称薯叶番茄,茎半蔓生,中等匍匐,果实与普通番茄相同;④梨形番茄,果小,如洋梨形,2室,红色或橙黄色,生长健壮,叶较小,色浓绿;⑤直立番茄,茎短而粗壮,分枝节短,植株直立,叶小色浓,叶面多皱褶,果柄短,果实扁圆球形,产量低,生产栽培很少。但因直立生长,栽培时无需立支架,便于田间机械化操作是其突出特点。