番茄茎为半直立或半蔓生，少数类型为直立型，茎基部木质化，易倒伏，分枝能力强。茎的分枝形式为合轴分枝，也叫假轴分枝，茎端形成花芽。根据番茄主茎叶片分化和花序分化的特点，可将番茄分为有限生长型、无限生长型两种类型。无限生长型的番茄在茎端分化第一个花穗后，其下的一个侧枝生长成强盛的侧枝，与主茎连续而成为合轴(假轴)，第二穗及以后各穗下的一个侧芽也都如此，故假轴无限生长。有限生长型的番茄植株则在发生3~5个花穗后，花穗下的侧芽变成花芽，不再长成侧枝，故假轴不再生长。
番茄茎的丰产形态为节间较短、茎上下部粗度相似。徒长株节间过长，往往从下至上逐渐变粗，而老化株则相反，节间过短，从下至上逐渐变细。
